年轻有为的孙飞研究院
生物物理这方向咱搞不懂,不过咱学院搞生物物理的,比如老马,对其工作是相当的推崇。另外,27岁教授也不单单是生命科学领域的现象,比如咱科大的校友周涛教授,1982年4月出生,2010年1月获聘电子科大的教授,是当时四川省最年轻的教授,译作《大数据时代》一书传遍大江南北。
当时四川省最年轻的教授,27岁就成为教授的周涛
第三,当然按惯例以上说的都不是重点,并且这些27岁的教授在获聘的时候也似乎没有引起什么争议。真正引起广泛争议的,是王MM,生物信息学家。王MM在2004年入选“百人计划”、研究员,当时是27岁。这事儿在当时不是有争议,而是吵翻了天。各种BBS、论坛上都是吵的一塌糊涂。反对的说,27岁评教授就是笑话。支持的说,你丫没本事就以为全世界都跟你一样是窝囊废?那次争吵可能是当时生物信息学版块的帖子头一回上十大。以至于后来大家都纳闷,学术版上非学术的帖子咋有这么大的争议?当然争议归争议,王MM做的可相当的好。咱生信要认2级的工作是吧(《如何成为顶级生物信息学家》)?
27岁获评教授,一度引起广泛争议的王秀杰
这个我很负责任的评论:有。2004年王MM以第一作者身份在Genome Biology上提出植物miRNA以及miRNA靶基因的预测算法,并且还有实验验证,所以这是2级上的工作。这篇论文被引用240多次,相当的惊人。所以你迅速就可以理解,王MM的研究方向必然会是植物非编码RNA的生物信息学研究。王MM算法和工具做的不算多,这是因为第一,她老板是非常正统的实验学家,生信与实验学的研究范式互不通约,所以实验背景的学者可以将生信当成一种方法,但不大可能完全信任其研究理念;第二,其时国内生命科学领域逐渐形成的研究范式是希望做出重要的生物学发现,解决生物学的问题。因此有必要折衷。所以国内从事生物信息学研究的女科学家,一般水平都不错的原因在于,男性对于不在自己知识框架里的东西会剧烈排斥,例如搞生信是否要做实验这类问题,而女性相对来说性格更温和,会先做起实验然后等等再看。
然后就是本篇主要讲的内容。3月5日最新一期的CellStem Cell杂志上,北京动物所的周琪研究员、基因组所的杨运桂研究员和王MM三个研究组合作,揭示RNA的转录后修饰(不是哥们儿我研究的翻译后修饰哦,那是蛋白质的,这是RNA的)N6-甲基化区域显著富集miRNA的结合位点,受到miRNA的调控,并且其修饰水平的升高能够提高小鼠胚胎成纤维细胞向多能干细胞的重编程诱导。这篇论文有计算,有实验。因为前两位主要关心的是具体的科学问题,所以其中的生物信息学分析必须是王MM研究组做的。论文结果的第一部分首先比较多能与分化的细胞系,看看序列特征,泛泛比较一下功能,这是典型的比较基因组的工作,属于生信的基本功之一。第二部分是比较N6-甲基化在两类细胞中的不同,鉴定细胞类型特异性的N6-甲基化。这里面算细胞类型特异性的N6-甲基化基因用的是熵法,最早是2005年GenomeBiology上一篇论文提出用来算组织特异性表达的基因。第三部分是发现N6-甲基化区域富集miRNA的结合位点,这是王MM的本行,所以显然不是问题。后面实验咱就不说了。所以这篇论文,生物信息学的分析是必须的,并且最核心的就是第三部分的内容,不长但是关键,有画龙点睛的效果。并且这一部分有区分度,不是做这一方向的生物信息学者,一般不会给你做这样的分析,就算给你分析也难保不出岔子。所以按生信的观点来看,这显然是篇3级的论文。加拿大华人网 http://www.sinoca.com/