由于其昂贵的入会费以及各种名目的教会活动收费，从创教开始，山达基已经发展成为一个每年全球总收入上亿美元的“企业”。1991年，山达基号称已在全世界建立了700多个活动中心，拥有500多万教徒。与此同时，因其涉嫌开展非正规医疗致人伤亡，通过精神控制进行敛财，对批评者进行有组织报复，以及前教徒揭露举报教会内部罪行，自上世纪60年代以来，各国政府对山达基采取了程度不同的调查和行动。图为在世界各地山达基教堂的开幕仪式。
1995年发生于美国的丽莎・麦克弗森案，被认为是山达基对患病教徒使用不当疗法，又不顾正规医师建议，劝病患不要在医院接受治疗，最终导致患者精神崩溃绝食死亡的案例。此案缠讼近10年，于2004年由山达基教会通过赔款达成庭外和解。2010年，山达基向澳大利亚酗酒原住民提供“药物弹疗法”，该药物除了会导致胃部溃疡，还会让原本患有肾脏疾病者死亡，被澳大利亚卫生部叫停。图为1998年12月5日，佛罗里达州克利尔沃特市，抗议者手举丽莎・麦克弗森照片声讨山达基。
山达基教义仇视现代心理治疗和精神病学，声称其治疗手段深具破坏性，必须被废止。山达基下属的志愿牧师群体相信他们拥有一套能医百病的“触摸援助法”，并在世界各地的灾难现场和心理治疗师及精神科医生直接竞争，尽力阻止他们接触病人。山达基教徒、台湾女演员张瑞竹曾说，身体不适的人，山达基都提倡不看医生，通过这种援助法就能自然治愈。图为2010年1月26日，海地太子港，山达基志愿牧师正在指导一位地震灾民学习“触摸治疗”。
批评者还指责山达基一系列的个人成长训练课程以各种名目敛财，尤其个人提升课程到中后段，费用极为高昂。山达基的官方网站从不正面透露学费金额，学费只有亲自到教会询问才能得知。另一方面，山达基出售昂贵的“心灵电仪表”获取钱财，而当一些退出的教徒在网上出售这种设备时，山达基教会以知识产权为由禁止出售。图为2008年2月10日，比利时布鲁塞尔，一名抗议者手举“宗教是免费的，而山达基不是”的标语参加示威。
面对各方打击，山达基也建立起一套严密的组织系统，对内严格控制教徒，对外向政府部门的要人、各种组织的领导人实施影响。1974年，山达基推行白雪行动计划，企图渗入多国政府和组织的办公室，盗窃所有涉及科学教的档案材料。1977年7月，美国联邦调查局逮捕了包括哈伯德妻子在内的11名山达基领导人。图为2009年5月29日，法国巴黎，山达基法国教会领导人之一阿兰・罗森伯格离开法庭时推开记者的手，他被控对教徒实施诈骗及非法供应药物。
随着山达基丑闻的暴露，越来越多的人站出来指控山达基违反个人愿望，强迫入教并进行非法监禁。前山达基教会成员瓦莱丝佳・帕里斯称，由于她的家人曾当众指责教会榨取巨额钱财，她从18岁起一直被强迫在名为“自由风”号的教会豪华游轮的下层做苦工，长达12年之久。“自由风”号是山达基最高级别课程的独家培训中心，在加勒比海长期巡游。教会称该游轮有着重大的宗教意义，因为教会创始人哈伯德在这艘游轮上研发了希坦(类似其他宗教中灵魂的概念)建议课程系统。值得一提的是，山达基一项饱受争议之处就在于其相信希坦转世，而且在灵魂生活在地球之前曾在别的星球上生活过。前山达基成员提到，这个秘密信息需要教徒支付数千美元后才会被告知。加拿大华人网 http://www.sinoca.com/
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