1995年至1996年台海危机期间，解放军跨区调动演习，北京军区的表现可圈可点，这为郭伯雄加分不少。
1999 年9月，郭伯雄再次奉调进京，任总参谋部常务副总参谋长，并增补为中央军事委员会委员，同月晋升上将军衔；2002年，郭当选为中央军委副主席，直至 2012年十八大后卸任。与郭伯雄同时奉调入京的，还有原济南军区政委徐才厚，他的新职务是解放军总政治部常务副部长，并同时增补为中央军委委员。
两人虽分属总参和总政，前者负责全军军事建设和军事行动指挥，后者主管全军政工和人事工作。在解放军总部任职后，两人工作中开始有了交集。
2002年，郭伯雄跳过总参谋长一职，率先晋位中央政治局委员、中央军委副主席，徐才厚则只升任总政治部部长。一直到2004年9月中共十六届四中全会，徐才厚才同样晋升至中央军委副主席。
自此，两人开始了长达10年的“搭班子”。
据知情人士透露，在此之前，两人的贪腐行为当属小打小闹。进入军委权力中枢后，两人的行为方式与此前大不相同。分析人士称，这两人权力膨胀到一定阶段后，开始进入到陶醉、迷恋、擅权的状态。
在任职总参、总政和中央军委的十多年里，两人在军队人事调动上频频擅权，特别是提拔谷俊山造成了恶劣影响。许多军队在职或退役高级将领认为，郭伯雄和徐才厚应对这些年军队的腐败丛生和蔓延负主要责任。
此外，两人的家属子女也借机敛财，门生故旧迎来送往，甚至司机秘书都在权力的裹挟下成为掮客。
围剿
2015年4月9日，中共中央依照党的纪律条例，决定对郭伯雄进行组织调查。而实际上，对郭伯雄的围剿至少在2014年10月30日的“新古田会议”前后已经开始。
新古田会议期间，习近平首次公开表示要进一步肃清徐才厚余毒。此时，军事检察院对徐才厚涉嫌受贿犯罪的案件侦查已经终结，并移送审查起诉。这意味着徐才厚已供述了该供述的一切，在掌握相应情况后，习近平借机敲打郭伯雄之意已很明显。
据悉，郭伯雄随后在古田住了很长一段时间，惶惶不可终日。
2014年年底，在军方年末人事变动中，多位与郭伯雄有交集的解放军将领被免职或外调。曾任郭伯雄秘书的北京军区原副司令刘志刚“被贬”调往济南军区，曾就职于兰州军区的北京军区副政委黄建国被免职，“去向不明”。
与此同时，解放军反腐进入高潮。军方于2015年1月15日通报了第一批16名已被查办的军级以上将领，其中至少2名与郭有过工作交集。其中郭伯雄的同乡且有上下级关系的新疆生产建设兵团副司令员来策义被免职；而被外界称为是郭伯雄“马仔”的兰州军区副政委范长秘在经过一段时间的“不知所踪”后，1月15日，中国军方证实其已被被查。
2015年3月2日，中央军委通报了第二批14名落马将领，其中就有郭伯雄之子郭正钢。郭正钢被查办后，郭伯雄落马的消息被传得沸沸扬扬。
就在外界广传郭伯雄被调查之际，3月23日，也就是郭正钢被查办20天后，郭伯雄曾长期待过的兰州军区召集军区团以上军事主官、参谋长等近400名军官进行为期5天的集训，引起外界关注。
与此同时，各路媒体起底郭氏家族的报道瞬时齐发。按照查办徐才厚、周永康时的媒体报道规律，在门生故旧，秘书身边人落马，家人敛财犯罪及发迹地机构单位的动向消息公开后，公布郭伯雄已被查办只是时间问题。
这已成为中共围猎党政军序列“大老虎”的规定动作。有分析指出，作为中纪委打虎惯用的“剪裙边”手法，郭伯雄身边人是否安全是检验“老虎”安全程度的“试金石”。
范长秘、来策义被查，刘志军、黄建国被贬，儿子被查办、家属职级、家庭情况被曝光，发迹地兰州军区人事调整动作连连，自然令外界联想起风雨飘摇的郭伯雄。
甘肃省军区一位退休将领向《中国新闻周刊》（微信ID：china-newsweek）证实，2015年4月中旬，有关方面正式向郭伯雄宣布了接受组织审查的通知已传达至各省、自治区、直辖市军政一把手。加拿大华人网 http://www.sinoca.com/
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